Различают пищеварительные и внепищеварительные функции пищеварительной системы.
Пищеварительные функции связаны с восприятием пищи, ее механической обработкой, продвижением по желудочно-кишечному тракту, химической переработкой. Желудок выполняет функцию депо пищи. Пищеварительные функции — это моторная, секреторная и всасывательная функции.
Непищеварительных функций несколько. Во-первых, это защитная функция. Соляная кислота желудочного сока обладает бактерицидным действием. Во-вторых, это гормональная функция. Некоторые отделы пищеварительного тракта вырабатывают гормоны и различные биологически активные вещества, поэтому 12-перстную кишку называют «гипофизом брюшной полости». В-третьих, слизистая оболочка пищеварительного тракта относится к органам выделения и обладает экскреторной функцией. Далее, благодаря экскреторной функции, которую выполняют главные пищеварительные железы и слизистая, желудочно-кишечный тракт участвует в поддержании кислотно-щелочного равновесия, регуляции объема водной фазы, сохранении концентрации солей. Это также коррегирующая функция. Между пищеварительной трубкой и жидкой внутренней средой организма существует кругооборот эндогенных органических веществ, а также воды и электролитов. Так, например, в полость желудочно-кишечного тракта в сутки поступает до 60 г эндогенного белка, который подвергается пищеварительному гидролизу. При этом освобождаются заменимые и незаменимые аминокислоты — своеобразный резервуар, из которого даже в условиях голодания организм может некоторое время получать вещества, необходимые для сохранения структур центральной нервной системы или мышцы сердца. Наконец, благодаря тому, что в желудке вырабатывается особое вещество — фактор Кастла, пищеварительная система принимает участие в регуляции выработки и созревания эритроцитов — эритропоэза.