Первый протестантский университет Германии; основан в 1527 гессенским ландграфом Филиппом Великодушным в Марбурге (назван в его честь); в 1541 получил имперские привилегии. Университет знаменит прежде всего благодаря свои гуманитарным кафедрам — здесь работали и учились видные богословы Р. Отто, Р. Бультман, философы Х. Вольф, М. Хайдеггер, Х. Г. Гадамер, Ф. А. Ланге, К. Левит, а также основатели Марбургской школы П. Наторп и Г. Коген. В университете в разное время учились и работали основатель русской науки М. В. Ломоносов, писатели Борис Пастернак, братья Гримм, Готфрид Бенн, президент ФРГ Г. Хайнеман, историк Г. фон Зибель, физиологи К. Ф. В. Людвиг, Э. Ф. В. Пфлюгер, химики Э. Франкленд, К. Циглер, А. Коссель, А. В. Г. Кольбе, Отто Ган, физики Д. Папен, Дж. Тиндаль, российский психолог С. Л. Рубинштейн.
В составе Марбургского университета 21 факультет, а также католическая семинария; в библиотеке (основана в 1527) 1, 9 млн томов и около 3 тысяч рукописей. При Марбургском университете научно-исследовательский институт немецкого языка — крупнейший центр по изучению немецкого языка и его диалектов (основан в 1876), издает атлас немецкого языка. В 2005 году в Марбургском университете обучалось 16, 3 тысяч студентов, работало свыше 7, 5 тыс профессоров, преподавателей и ассистентов.