Гомологи́чные о́рганы, в биологии — органы, имеющие принципиально общее строение независимо от сходства выполняемых ими функций.
Сходство в строении, или гомология, возможно только при наличии более или менее отдалённого общего предка. В этом состоит эволюционный критерий гомологии. На практике обычно используют более доступные эмбриологический (наличие общих стадий в эмбриогенезе) или морфологический (структурное подобие), реже — палеонтологический (наличие общих или переходных ископаемых форм) критерии. Однако использование различных критериев часто приводит к несовпадению оценки гомологии на разных уровнях. Так, крыло насекомых (складка покровов) аналогично крылу позвоночных (видоизменённой передней конечности). Крылья разных позвоночных (птерозавра, птицы и летучей мыши) гомологичны согласно эволюционному и эмбриологическому критериям. При этом морфологически крылья птерозавра и летучей мыши гомологичны друг другу (перепонка, натянутая между пальцами и задней конечностью), но аналогичны крылу птицы (конечность с укороченными пальцами, покрытая перьями). Нередко гомологичные органы выполняют совершенно разные функции. Например косточки среднего уха млекопитающих и четвёртая жаберная дуга костных рыб, гастроваскулярная система гребневиков и целом иглокожих. Генетические основы возникновения гомологичных структур у относительно близкородственных форм отражает закон гомологических рядов. Некоторые гомологичные структуры встречаются у столь не родственных групп, что могут свидетельствовать о единстве происхождения всех животных или всех эукариот. Таково, например, тонкое строение жгутиков, а также молекулярная структура гемоглобинов и цитохромов .