Башки́рский запове́дник, расположен в Башкирии, на отрогах Южного Урала в излучине река Белая, включает также акваторию Нугушского водохранилища. Заповедник основан в 1930 для сохранения биоразнообразия широколиственных и смешанных лесов Южного Урала. Площадь 49 609 га. В состав заповедника входили два обособленных участка: Узянский и Прибельский.
В 1986 на базе Прибельского участка образован самостоятельный заповедник «Шульган-Таш». Он приурочен к границе природных зон и биогеографичеких областей, что определяет повышенное биоразнообразие экосистем. Здесь — одно из последних мест сохранившейся популяции среднерусской дикой пчелы.
В Башкирском заповеднике преобладает горный рельеф с характерными для этой части Урала выровненными и сглаженными вершинами хребтов. Самая высокая отметка 930 м над уровнем моря. Доминирующие лесные ландшафты (около 90% территории) здесь сочетаются со степными и луговыми. Через заповедник и его окрестности проходит граница между европейскими и уральско-сибирскими лесами, что обусловило разнообразие типов леса, их чередование на относительно небольших участках.
Флора заповедника насчитывает почти 690 видов высших сосудистых растений. Древостой образуют сосна, береза, клен, ильм, черемуха, рябина; в западной части заповедника распространены дуб и липа, в восточной — лиственница. Под пологом леса хорошо развит травянистый покров.
Здесь зарегистрирован 51 вид млекопитающих; обычны различные грызуны: южная и красная полевки, белка, кроты, заяц-беляк, летяга; хищники: лесная куница, рысь, бурый медведь; копытные: лось, косуля, кабан. Акклиматизированный когда-то марал сильно размножился и расселился в окрестные лесные угодья. В заповеднике встречаются 155 видов птиц. Из крупных лесных птиц в заповеднике обитают тетеревиные: рябчик, глухарь, тетерев, некоторые виды дневных хищников и сов. Попадаются серый журавль, вальдшнеп, большой крохаль, несколько видов дятлов, глухая и обыкновенная кукушки. Многочисленны птицы отряда воробьиных. Учеными уже длительное время изучаются естественный ход процессов в природных комплексах гор Южного Урала (Капова пещера), результаты интродукции чуждых для заповедного комплекса видов растений и животных, влияние антропогенного фактора; разрабатываются меры, способствующие сохранению и восстановлению коренных экосистем.