Аутоимму́нные заболева́ния — болезни, обусловленные реакциями иммунитета, направленными против собственных тканей и органов (коллагенозы, нефрит). Аутоимунные заболевания различают по механизму возникновения. В первую группу включают болезни, развивающиеся в результате нарушения сосудисто-тканевого барьера и высвобождения физиологически изолированных антигенов, которыми могут быть ткань мозга, щитовидной железы, хрусталика, сперматозоиды. Организм не обладает устойчивостью (толерантностью) к этим антигенам и отвечает на них иммунной реакцией с образованием иммунных лимфоцитов и антител. Заболеваниями такого типа могут быть энцефаломиелит, болезнь Хасимото (диффузная инфильтрация щитовидной железы лимфоидными клетками с нарастающими явлениями тиреотоксикоза, то есть отравления ее гормоном — тироксином; впервые описана японским ученым Х. Хасимото в 1912), эндофтальмит (воспаление внутренней оболочки глаза), увеит (воспаление сосудистого, или увеального, тракта глаза), асперматогенез (прекращение образования сперматозоидов), панкреатит, аддисонова болезнь.
Ко второй группе относятся заболевания, вызываемые собственными тканевыми компонентами организма, измененными под влиянием физических, химических, микробных, вирусных факторов. Собственные компоненты настолько изменяют свои свойства, что воспринимаются организмом как чужеродные. Многие аутоимунные заболевания крови (анемия, лейкопения, тромбоцитопения) объясняются способностью антигенов, попавших в организм извне, или экзоантигенов (например, лекарственных веществ или бактериальных токсинов) фиксироваться на поверхности клеток благодаря простой адсорбции или образованию комплексных антигенов, сохраняющих антигенные свойства составных частей комплекса. Антитела, направленные против экзоантигена, вызывают повреждения клеток. В процессе взаимодействия собственных тканевых компонентов организма с экзоантигенами (например, вирусами) могут образоваться промежуточные антигены с новыми антигенными свойствами. По такому типу развиваются болезни центральной нервной системы. В третью группу объединяют заболевания, развивающиеся вследствие родства собственных компонентов ткани с экзоантигенами. При этих заболеваниях иммунологическая реакция, вызванная экзоантигеном, может быть направлена против собственной ткани.
Четвертая группа аутоимунных заболеваний включает заболевания, в основе которых лежат нарушения функции лимфоидной ткани, появление клеток, разрушающих собственные ткани организма. Такое нарушение иммунологического аппарата связано с генетическими особенностями организма или с повышенной мутацией (стойкими изменениями) лимфоидных клеток, возникающей под влиянием неблагоприятных внешних воздействий (химических веществ, радиации). Примером такого заболевания может служить системная красная волчанка. Большинство аутоимунных заболеваний развивается по типу аллергических реакций замедленного типа с участием иммунных лимфоцитов. При аутоиммунных поражениях крови первостепенное значение имеют циркулирующие в крови антитела.