Ятрохи́мия — направление в естествознании и медицине 16-18 веков, представители которого рассматривали процессы, происходящие в организме, как химические явления, а болезни — как результат нарушения химического равновесия и ставили задачу поиска химических средств их лечения. Термин образован от греческого слова «ятрос» — врач. Зарождение и развитие ятрохимии, получившей наибольшее распространение в Германии и Нидерландах, связано с деятельностью Парацельса, Я.Б. ван Гельмонта, А. Либавия, врача и анатома Ф. Боэ (Сильвиуса, 1614-1672), сформулировавшего основные положения ятрохимии и открывшего при Лейденском университете первую химическую лабораторию для анализов. Их исследования способствовали формированию химии как самостоятельной науки.
Представители ятрохимии уделяли особое внимание изучению процессов пищеварения, а также желез (особенно половых желез); различали «кислотные» и «щелочные» болезни. По существу, яторохимия подводила научную (химическую) основу под теорию гуморальной патологии. Критиком ятрохимии выступил Р. Бойль который указывал, что химия имеет самостоятельную задачу «определения состава веществ, что позволит обогатить и медицину». Сыграв положительную роль в борьбе с догмами схоластической средневековой медицины, ятрохимия во второй половине 18 века перестала существовать как направление в медицине.