Юрисдикция над иностранными судами в территориальных водах — осуществляется как государством флага, так и прибрежным государством. Основными международно-правовыми документами, регулирующими Ю.н.и.с. в т.в., являются Женевская конвенция о территориальном море и Прилежащей зоне 1958 г. и Конвенция ООН по морскому праву 1982 г.
При осуществлении мирного прохода в территориальных водах прибрежного государства иностранные суда обязаны соблюдать соответствующие законы и правила последнего. Однако при этом иностранные торговые суда не должны облагаться никакими сборами. Прибрежным государством, как правило, не осуществляется уголовная юрисдикция для ареста какого-либо лица или производства расследования какого-либо преступления, совершенного на борту иностранного судна, проходящего через его территориальные воды. Исключениями из этого правила являются случаи, когда: а) последствия преступления распространяются на прибрежное государство; б) совершенное преступление нарушает спокойствие в стране или порядок в территориальном море; в) капитан судна, дипломатический агент или консульское должностное лицо государства флага обратятся за помощью к местным властям, а тж. когда такие меры необходимы для пресечения незаконной торговли наркотиками или психотропными веществами. Кроме того, предусматривается возможность осуществления уголовной юрисдикции прибрежного государства для ареста или расследования на борту иностранного судна, находящегося в территориальных водах после выхода из внутренних вод. Гражданская юрисдикция в отношении какого-либо лица, находящегося на борту проходящего в территориальных водах судна, по общему правилу не осуществляется. Однако согласно ст. 20 Конвенции 1958 г. и ст. 28 Конвенции 1982 г. прибрежное государство может применять меры взыскания или арест по любому гражданскому делу в отношении иностранных торговых судов, находящихся на стоянке в территориальном море или проходящих через территориальное море после выхода из внутренних вод. Аналогичные меры предусмотрены и в отношении судов, проходящих через территориальные воды, но только по обязательствам или в силу ответственности, принятой или навлеченной на себя этим судном во время или до прохода его через воды прибрежного государства. При подписании и ратификации Конвенции 1958 г. СССР сделал оговорку к ее ст. 20, указав на то, что государственные суда в силу их иммунитета не могут подвергаться таким мерам без согласия государства флага.