Монастырский двор, увитый виноградным плющом, разбит в форме неправильного шестиугольника. Пройдя внутрь двора мимо сторожевой башни, вы увидите двух- и трехэтажные деревянные постройки с балконами и деревянными колоннами, потемневшими от времени. В этих домах размещены монашеские кельи с печами, трапезная, усыпальница и ферма. Во все служебные строения стоит заглянуть, трапезная, к примеру, покрыта росписями XVI – XVII вв. С восточной стороны трехэтажных монастырских построек высится изящная расписная колокольня.
Монастырская усыпальница расписана фресками, посвященными житию Иоанна Крестителя (17 в.).
Главная монастырская церковь Рождества Богородицы, построенная в 16 веке, дала название соседней деревне — Рожен. Сохранились фрески над входом (1657) с изображением Иисуса Христа и двенадцати апостолов. Фасад церкви с противоположной стороны украшен фресками «Страшный суд» и «Лестница праведников» (1661). Внутренние росписи сделаны в 1727 году живописцами Теохаром и Николой. Деревянный иконостас украшен затейливой резьбой: сцены из Ветхого Завета переплетены с растительным орнаментом и фигурками животных. В церкви можно полюбоваться на витражное стекло (1715). К северному фасаду примыкает часовня Св. Косьмы и Дамиана, возведенная в 1732 году на средства монахини Мелании. До наших дней дошел портрет дарительницы с моделью часовни в руке.
Главная святыня монастыря – икона Девы Марии «Портаисса» (Вратарница), написанная в 1790 году монахом Ивирона Иаковом, копия афонской чудотворной иконы. В монастыре было создано уникальное произведение Роженской каллиграфской школы, существовавшей здесь еще в 14 веке, — рукописный список «Толкования Иова», хранящийся ныне в Храме Гроба Господня в Иерусалиме.