Флаг Анадыря был принят 14 октября 2005 года. Флаг сине-голубого цвета имеет вдоль нижнего края белую волнистую полосу, на которой в центре возвышается главная фигура из герба города: медведь золотисто-желтого цвета (цвета охры) с белыми когтями, держащий рыбу красного цвета головой вверх. Контур и прорисовка деталей изображений медведя и рыбы — пурпурного (бордового) цвета.