Штамм — чистая культура определенного вида микроорганизма, у которого изучены морфологические и физиологические особенности. Немецкое Stamm буквально означает «ствол», «основа». Штаммы могут быть выделены из различных источников (почвы, воды, пищевых продуктов) или из одного источника в разное время. Поэтому один вид бактерий, дрожжей, микроскопических грибов может иметь большое число штаммов, отличающихся по ряду свойств, например по чувствительности к антибиотикам, способности к образованию токсинов, ферментов. Производственные шаммы микроорганизмов, применяемые в промышленности для микробиологического синтеза белков (в том числе ферментов), антибиотиков, витаминов, органических кислот, значительно продуктивнее (в результате селекции) диких штаммов.