Фла́гманский кора́бль — главный корабль, тот, на котором находится командующий соединением кораблей. На флагманском корабле находится командный пункт, необходимые средства управления; также ему присваивается флаг командира данного отделения. К тому же флагманскими кораблями называют главные корабли пароходств, флотилий промысловых судов и др.