Сохранились императорская мечеть Джама-Масджид, гробница шейха Салима Чишти, пятиэтажный прогулочный павильон Панч-Махал, зал общих и зал частных приемов, дворцы жен и приближенных.
В ходе археологических раскопок в Фатехпур-Сикри обнаружены также следы городского поселения домогольского времени. Среди находок джайнистский храм (11 в.), скульптуры (начиная со 2 в. н. э.).