Трахе́я — орган дыхательных путей позвоночных животных и человека; расположена между гортанью и бронхами впереди пищевода. У земноводных трахея не разделяется на бронхи (легкие начинаются от трахеи) и не у всех обособлена от гортани: у бесхвостых земноводных трахея отсутствует, легкие начинаются от гортани. У хвостатых земноводных трахея обычно длинная, с парными хрящиками, которые иногда срастаются. У пресмыкающихся, птиц и млекопитающих трахея хорошо обособлена от гортани и делится на бронхи. Длина трахеи прямо пропорциональна длине шеи и обратно пропорциональна длине бронхов. У пресмыкающихся скелет трахеи состоит из полных или неполных хрящевых колец, у птиц — обычно из цельных окостеневающих колец, образуя у некоторых из них многочисленные извивы и расширения, играющие роль резонаторов. У многих птиц нижние кольца участвуют в образовании так называемой нижней гортани. Скелет трахеи млекопитающих образован хрящевыми полукольцами (замкнутые кольца есть у бобра, агути, шерстокрыла, лемуров). Спинная сторона трахеи обычно перепончатая; к ней прилегает пищевод. У китообразных и сиреневых млекопитающих хрящи трахеи частично сливаются между собой, образуя подобие спирали. Трахея обычно разделяется на два бронха в грудной полости; у некоторых животных от трахеи отходит добавочный бронх (зубатые киты, жвачные, свиньи).
Трахея человека — дыхательное горло, непосредственное продолжение гортани, имеет вид трубки длиной 11-13 см, состоящей из 16-20 хрящевых полуколец, соединенных плотной волокнистой соединительной тканью. Трахея выстлана слизистой оболочкой. В подслизистом слое много смешанных слизистых желез. Воспаление слизистой оболочки трахеи называется трахеитом.