Обучение клинических ординаторов осуществляется по специальностям, предусмотренным номенклатурой врачебных специальностей и в соответствии с учебным планом и программой по каждой специальности. Обязательный минимум профессиональной образовательной программы по конкретной врачебной специальности устанавливается государственным стандартом. Программы обучения в клинической ординатуре и учебные планы утверждаются учеными советами учреждений, осуществляющих подготовку клинических ординаторов, и пересматриваются каждые пять лет с учетом изменений государственного стандарта образовательного минимума профессиональной образовательной программы по каждой специальности. Продолжительность обучения в ординатуре составляет два года. Врачам, обучающимся в клинической ординатуре, выплачивается стипендия.