Межгосударственный экономический комитет (МЭК) – постоянно действующий координирующий и исполнительный орган Экономического союза. Соглашение о создании МЭК Экономического союза подписано в г. Москве 21 октября 1994 г. представителями государств – членов Экономического Союза (кроме Туркменистана). Соглашением утверждено Положение о Межгосударственном экономическом комитете Экономического союза. Целью МЭК является формирование и обеспечение эффективной деятельности Экономического союза, рационального развития интеграционных процессов в рамках Содружества Независимых Государств. МЭК осуществляет контрольные и распорядительные функции в пределах полномочий, добровольно делегированных ему государствами – участниками Договора о создании Экономического союза.
В своей деятельности МЭК подотчетен Совету глав государств и Совету глав правительств СНГ, руководствуется Уставом СНГ, Договором о создании Экономического союза, решениями Совета глав государств и Совета глав правительств Содружества, межгосударственными и межправительственными соглашениями. МЭК принимает решения распорядительного характера по вопросам, добровольно переданным ему государствами; решения, обязательность исполнения которых должна подтверждаться соответствующими решениями правительств, в т.ч. по вопросам сохранения мобилизационных мощностей, поддержания эффективных кооперированных связей, структурных изменений, охраны окружающей среды и природных ресурсов. МЭК может принимать тж. и решения рекомендательного характера.
Руководящими органами МЭК являются Президиум и Коллегия. Президиум является высшим органом МЭК, он состоит из заместителей глав правительств государств – участников Договора о создании Экономического союза и собирается на свои заседания по мере необходимости, но не реже одного раза в квартал. Президиум возглавляет Председатель. Он избирается на один год из числа заместителей глав правительств, входящих в состав Президиума.
В период между заседаниями Президиума функции его рабочего органа выполняет Коллегия. Она состоит из полномочных представителей государств – участников Договора о создании Экономического союза, Председателя и его заместителей. Коллегию возглавляет Председатель, который назначается Советом глав государств по представлению Совета глав правительств Содружества сроком на три года. Коллегия работает на постоянной основе, осуществляет непосредственное руководство деятельностью Аппарата МЭК и в пределах своей компетенции принимает оперативные решения и меры. Регламент работы Коллегии устанавливает Президиум. Основные решения Президиум и Коллегия МЭК принимают только консенсусом или квалифицированным (в 3/4) большинством голосов. Местом нахождения МЭК является г. Москва. Рабочим языком МЭК является русский язык. МЭК является юридическим лицом, условия пребывания которого на территории РФ определяются отдельным соглашением между государствами – участниками Договора о создании Экономического союза и РФ.