Ма́трикс в биологии — мелкозернистое полужидкое вещество, заполняющее внутриклеточные структуры (ядра, митохондрии, пластиды) и пространства между ними. Различают цитоплазматический матрикс, или основное вещество (масса, проявляющая в зависимости от физиологического состояния клетки способность к вязкому течению или к упругой деформации), матрикс митохондрий (полужидкое вещество, заполняющее пространства между кристами, или гребнями, митохондрий), матрикс клеточного ядра, пластид. Цитоплазматический матрикс состоит главным образом из агрегированных в разной степени белковых молекул и служит поддерживающей средой для клеточных органоидов; в нем находятся базальные тельца, центриоли, нити, микротрубочки.