Иску́сственный отбо́р — отбор человеком из поколения в поколение животных и растений, обладающих полезными наследственными признаками, для дальнейшего разведения. Искусственный отбор — основной фактор возникновения и эволюции домашних животных и культурных растений. Впервые роль искусственного отбора отметил Ч. Дарвин (1859). Искусственный отбор основан на изоляции природных популяций и искусственном скрещивании организмов, обладающих признаками, желательными для человека. Оставляя для размножения лучших особей с полезными хозяйственными качествами, люди изменяют в нужную сторону частоту встречаемости алеллей в размножаемой популяции. Генофонды этих групп изолированы, но они сохраняют основную генную и хромосомную структуру вида, к которому они принадлежат. Повышая продуктивность размножаемых организмов, человек обращал внимание лишь на полезные ему признаки. В результате многие породы не могут размножаться без помощи человека.
Выделяют следующие виды искусственного отбора: инбридинг (родственное размножение), аутбридинг (неродственное размножение). Инбридинг состоит в избирательном скрещивании между близко родственными особями в целях сохранения и распространения желательных признаков. Этот метод часто применяется для разведения кошек и собак. Длительное применение этого метода может привести к снижению плодовитости. При интенсивном инбридинге уменьшается изменчивость генома и, следовательно, повышается число гомозиготных генотипов. Для того чтобы преодолеть эти проблемы, следует прибегать к аутбридингу. Аутбридинг проводят между представителями разных сортов или линий, иногда между близко родственными видами. Потомков таких скрещиваний называют гибридами. Они превосходят по ряду признаков обе родительские формы — это явление называется гетерозисом. Иногда гибридизация может сопровождаться изменением числа хромосом — полиплоидизацией, которая может приводить к возникновению новых видов. Искусственный отбор применяется и для микроорганизмов: этим путем получают штаммы, например, плесневых грибов, вырабатывающих пенициллин.