Институ́т биоло́гии ю́жных море́й А. О. Ковалевского — федеральный научно-исследовательский институт Российской академии наук. Расположен в Севастополе.
История института началась еще в середине 19 века, когда в 1869 году в Москве состоялся 2-й съезд естествоиспытателей и врачей, на котором выступил Н. Н. Миклухо-Маклай, призвавший создавать морские биостанции для развития исследований на морях. Съезд поддержал его и принял решение о создании Севастопольской биостанции. Выполнение этого решения взяло на себя Общество естествоиспытателей при Новороссийском университете, в котором в это время работали такие выдающиеся биологи, как А. О. Ковалевский, И. И. Мечников, И. М. Сеченов, В. В. Заленский и Л. С. Ценковский, принявшие непосредственное участие в основании первой в Российской империи морской биологической станции, которая была открыта в 1871 году.
Ее первым директором был назначен А. О. Ковалевский, по инициативе которого в 1891 году СБС была переведена в ведение Академии наук, что упрочило ее положение как научного учреждения и расширило возможности научных исследований. А. О. Ковалевский отдал много сил по организации работы станции, созданию уникальной библиотеки и постройки собственного здания биостанции и устройстве публичного морского аквариума.
В 1902-1918 гг. директором СБС был академик В. В. Заленский. В это же время на станции начинает работать в должности старшего зоолога будущий академик С. А. Зернов. Благодаря их усилиям на СБС широко развертываются как научные, так и прикладные исследования по экологии видов фауны и флоры, сезонной динамики жизни черноморского планктона, распределению донных организмов в севастопольской бухте и прилегающей части Черного моря, формируется научный флот СБС.
В 1931 году по предложению С. А. Зернова на пост заместителя директора СБС был назначен В. А. Водяницкий. В это время осуществляются экспериментальные работы по проблемам реконструкции фауны южных морей (Черное, Азовское, Каспийское) в интересах человека под руководством профессора Л. А. Зенкевича. В 1947 году Севастопольской биостанции было присвоено имя А. О. Ковалевского.
В 1958 году начались экспедиционные исследования на Средиземном и Красном морях с целью получения сравнительных данных о количественном развитии жизни и продуктивности. Позднее эти работы были распространены на Центрально-Американские моря и тропическую зону Атлантического океана.
В 1961 году был решен вопрос о передаче СБС в ведение АН УССР, а в 1963 году на базе биостанции был образован Институт биологии южных морей АН УССР с центром в Севастополе, а его директором был назначен В. А.Водяницкий, разработавший программу исследований института. Преобразование СБС в институт значительно расширило объем научно-исследовательских работ, увеличилось количество отделов, вырос штат. В состав ИнБЮМ вошли самая молодая биологическая станция (основана в 1954 году) в Одессе и созданная на личные средства приват-доцента Московского университета врача Т. И. Вяземского в 1914 году первая в мире природная Карадагская биологическая станция.
До 2014 года Институт биологии южных морей являлся научно-исследовательским комплексом, входил в состав Отделения общей биологии НАН Украины и являлся базовой организацией Океанологического центра НАН Украины.
Постановлением Правительства г. Севастополя № 110-ПП от 24 февраля 2015 года ИнБЮМ был реорганизован в Государственное бюджетное научное учреждение «Институт биологии южных морей имени А. О. Ковалевского» г. Севастополя (ГБНУ ИнБЮМ), на базе которого постановлением Правительства Российской Федерации создано Федеральное государственное бюджетное учреждение науки «Институт морских биологических исследований имени А. О. Ковалевского РАН» (ФГБУН ИМБИ).
25 июня 2019 года институту вернули историческое название.
В том же году был создан первый в Крыму и Севастополе Федеральный исследовательский центр — Институт биологии южных морей имени А. О. Ковалевского (ФИЦ ИнБЮМ). В состав ФИЦ вошли Институт морских биологических исследований имени А. О. Ковалевского РАН и Карадагская научная станция им. Т. И. Вяземского (филиал).
В состав ФИЦ ИнБЮМ входят: филиал — «Карадагская научная станция им. Т. И. Вяземского — природный заповедник РАН» и представительство в г. Москве, 13 научных отделов, в составе двух из них выделены структурные лаборатории, 3 самостоятельных лаборатории, НИС «Профессор Водяницкий».
Основные направления научных исследований: изучение механизмов адаптации, трансформации и эволюции морских систем в условиях климатических изменений и антропогенного воздействия; создание методов и технологий оперативного контроля экологического состояния биоты, оценка и прогноз качества морской среды и экологического риска в зонах активного мореиспользования, а также исследование биологического разнообразия Черноморско-Азовского бассейна и разработка эффективных мероприятий для его сохранения. Являясь ведущим научным учреждением по вопросам сохранения морской окружающей среды, устойчивого развития и биоразнообразия, институт разрабатывает актуальные проблемы мировой науки по созданию новых технологий охраны окружающей среды и воспроизводства биологических ресурсов.
- Отдел физиологии животных и биохимии
- Отдел функционирования морских экосистем (ФМЭ)
- Отдел планктона
- — Cтруктурная лаборатория микропланктона
- Отдел экологии бентоса
- Отдел радиационной и химической биологии (ОРХБ)
- Отдел морской санитарной гидробиологии
- Отдел экологической паразитологии
- Отдел ихтиологии
- Отдел экологической физиологии водорослей
- Отдел аквакультуры и морской фармакологии
- Отдел биофизической экологии
- Отдел биотехнологий и фиторесурсов
- — Структурная лаборатория фиторесурсов
- Лаборатория БиФГМО
- Научно-исследовательский центр геоматики
- ЦКП «Коллекция гидробионтов мирового океана ФИЦ ИнБЮМ»
- ЦКП «Спектрометрия и хроматография»..