Длина тела 11—13, 5 см, хвоста 10—13 см, ступни 23—28 мм (более крупная, чем лесная мышь). На груди между передними ногами всегда имеется охристое пятно разной величины и формы.
Ареал этого вида чуть меньше, чем у лесной мыши. В некоторых местах (оврагах, садах, парках) желтогорлые и лесные мыши живут вместе, но численность их одинаковой не бывает. Где много желтогорлых мышей, лесных мало или совсем нет, и наоборот. Если в клетку к желтогорлой мыши подсадить лесную мышь (любого пола и возраста), первая загрызет вторую. Численность мелкого вида зависит от численности крупного.