Бонапа́рт Шарль Люсьен (полн. Шарль Люсьен Жюль Лоран Бонапарт, Charles Lucien Jule Laurent Bonaparte) (24 мая 1803, Париж — 29 июля 1857, там же), принц Канино и Музиньяно, французский и итальянский ученый-зоолог и политический деятель, участник Итальянской революции 1848-1849, старший сын Люсьена Бонапарта.
Получив образование в различных итальянских университетах, Шарль Люсьен отправился в Северную Америку для изучения местной фауны. Плодом его исследований стала публикация в 1825-1833 четырех томов «Американской орнитологии». Этот труд создал Шарлю Люсьену репутацию серьезного ученого, принес признание в научном мире. Вернувшись в Италию, он поселился в Риме, и в 1833-1841 опубликовал трехтомный труд, посвященный позвоночным животным Италии. Помимо того, Шарль Люсьен публикует ряд работ, освещающих различные вопросы зоологии. Он прикладывал немало усилий к созданию сообщества итальянских ученых, устраивал их периодические собрания, на которых решались вопросы координации научной деятельности и объединения научных сил Италии. Супругой Шарля Люсьена в 1822 стала его двоюродная сестра, дочь Жозефа Бонапарта — Зинаида Шарлотта Жюли (1801-1854).
Революционные события 1848-1849 заставили Шарля Люсьена отставить в сторону свои ученые занятия. Он принял активное участие в борьбе итальянских патриотов против австрийского господства, в деятельности партии либералов в Риме. После образования Римской республики Шарль Люсьен Бонапарт занимал в ней посты вице-президента и председателя учредительного собрания. В 1849, после оккупации Рима французскими войсками, ему пришлось бежать из Италии. Он появился в Марселе, но правительство Луи Бонапарта (будущего Наполеона III) выслало его из страны. Но уже во второй половине 1850 изгнанник обосновался в Париже, где вернулся к своим научным занятиям. В 1854 он стал директором Ботанического сада. В 1850-х Шарль Люсьен опубликовал еще ряд научных работ, посвященных общей зоологии, систематике видов, орнитологии, ихтиологии.
Шарль Люсьен Бонапарт был отцом восьмерых детей: трех сыновей и пятерых дочерей. После его смерти титул принца Канино волей Наполеона III был передан его младшему брату Луи Люсьену. Старшему сыну Шарля Люсьена — Жозефу Люсьену Шарлю Наполеону (1824-1865) достался только титул принца Музиньяно. Второй сын — Люсьен Луи Жозеф Наполеон (1828-?), сделал карьеру при папском дворе, он был тайным камергером римского папы и кардиналом. Третий сын Григори Жак Филипп (1839-?) в 1859 женился на княжне Марии Христине Русполи. Все дочери вышли замуж за различных итальянских аристократов, и потомство Шарля Люсьена окончательно обосновалось в Италии.