Основное здание находится в центре Берлина, на Унтер-ден-Линден. В университете обучается около 37 тыс студентов (2004, в том числе 4 тыс иностранных студентов).
Основан в 1810 немецким филологом и философом Вильгельмом Гумбольдтом. С 1828 официально назывался Университетом Фридриха Вильгельма. В 1949 назван в честь своего основателя. После 1933 Берлинский университет, как и другие университеты в Германии, стал нацистским учебным заведением; 20 тыс книг из его библиотеки были церемониально сожжены, еврейские студенты и неугодные режиму преподаватели были вытеснены из университета. В 1946 университет оказался в советской части Берлина и был открыт уже в составе ГДР. В 1948, в противоположность Берлинскому университету, ставшему проводником социалистической идеологии, был создан Открытый Берлинский университет. В 1990, после объединения Германии, коммунистическая идеология была отменена, в преподавательский состав вуза вошли крупнейшие ученые из Западного Берлина. Среди выпускников и преподавателей университета философы И. Г. Фихте, Ф. Шлейермахер, Г. В. Ф. Гегель, Ф. К. Савиньи, А. Шопенгауэр, Ф. В. Шеллинг, физики А. Эйнштейн, М. Планк; университет окончили 29 нобелевских лауреатов.