В Балтистане находится вторая по высоте гора мире — пик Чогори (8611 м), а также вершины высотой 8068 и 8047 м. В горах расположены несколько ледников, крупнейший их них — Балторо. Климат Балтистана — горный, резко континентальный. Осадков выпадает мало — 150 мм в год. Долины располагаются на высоте от 2500 до 3000 м. Балтистан заселен народностью балти тибетского происхождения, исповедующих ислам шиитского толка.