Древнейшие памятники (археологические остатки т. н. культуры Нагада, гробницы) относятся к 4 тыс. до н. э. Уже первые египетские фараоны (I-II династия, начало 3 тыс. до н. э.) избрали Абидос со святилищем шакалоголового бога мертвых Хентиаменти (древнеегип. — «Предводитель западных») местом своего погребения. Позднее, с конца 3 тыс. до н. э., святилище перешло к новому владыке загробного мира — Осирису, голова которого, как предполагают, была захоронена в Абидосе. А поскольку легенда об Осирисе обещала вечную жизнь всем, даже простому народу, очень многие хотели быть похоронены именно здесь. Если перевезти останки умершего было невозможно, сооружались так называемые ложные гробницы, поминальные колонны или же путь покойника в Абидос изображался в виде настенной фрески. Абидос становится центром культа Осириса.
С эпохи Среднего царства в Абидосе проводились мистерии в честь Осириса. Сохранились многочисленные кенотафы частных лиц, желающих быть «погребенными» вблизи центра его культа. Одна из самых замечательных храмовых построек Египта — храм Сети I в Абидосе, посвященный богу Осирису. Фараон Рамсес II приказал достроить его для своего умершего отца.
В мотивах росписи стен и барельефах опять Сети I предстает перед нами как воин, ведущий битву с хеттами, или в окружении богов. В галерее фараонов рядом с левым выходом один из барельефов представляет Сети I с маленьким Рамсесом у колен.
В 1818 г. Бонкесом была найдена знаменитая «Абидосская доска» с иероглифами и списком 76 фараонов-предшественников Рамсеса II, в 1835 г. приобретенная Лондонским музеем. В храме Сети I была обнаружена подобная, дополняющая предыдущую находку. Этот обнаруженный «список фараонов» послужил египтологам важнейшим ключом для дешифровки иероглифов и составления хронологии династий Древнего Египета.