Пустозе́рск, русское поселение 16-18 веков у озера Пустое (или Городецкое) в низовьях Печоры (ныне территория Ненецкого округа). Пустозерск был основан в 1499 году воинской экспедицией во главе с С. Курбским, П. Ушатым, В. Заболотским-Бражником, как укрепленный пункт в Югорской земле для сбора ясака. Здесь жили воеводы, управлявшие краем и до 1780 года городок был административным центром Пустозерской волости. Пустозерск служил местом ссылки. Во второй половине 17 века сюда был сослан протопоп Аввакум. Здесь же он был сожжен. Позже В Пустозерск были сосланы боярин Артамон Матвеев и князь В.В. Голицын.
Период наибольшей активности Пустозерск пережил в 17 веке. В то время Пустозерск представлял собой небольшой городок с жилыми деревянными домами, воеводской канцелярией, церквями, таможней, тюрьмой, фортом, магазинами, амбарами. Население занималось рыбной ловлей, промыслом морского зверя и торговлей. В то время городок лежал на пути из России в Сибирь. В 18 веке был открыт более удобный южный путь в Сибирь через Уральские горы и городок на Печоре постепенно пришел в упадок.
С основанием города Мезени (1780) Пустозерск утратил значение административного центра и стал селом Печорского уезда Архангельской губернии. Торгового и промышленного значения он не имел, его население постоянно сокращалось. Если в 1843 году в Пустозерске было четыре церкви, то к концу века осталось только две, при населении в 130 человек. Последние жители покинули село в начале 1960-х годов.