Пекинский зоопарк имеет древнюю историю как императорский зверинец. В 18 в. был известен как сады «Санбези». В 1906, в период правления императора Дэцзун, парковая зона стала экспериментальной фермой-зоопарком. В 1908 под названием «Сад Десяти Тысяч Животных» зоопарк был открыт для публичного посещения. В период отсутствия центральной власти, гражданской войны и японской интервенции зоопарк пришел в упадок. В 1937 в зоопарке умер последний слон, а крупные хищники были убиты японским войсками.
В 1949, когда зверинец перешел в собственность Китайской Народной Республики, здесь содержались всего лишь 12 обезьян, два попугая и слепой эму. Зоопарк был открыт вновь в 1950, с 1955 — современное название. Зоопарк быстро развивался, активно строились все новые и новые павильоны. В конце 50-х были завезены наиболее крупные животные: медведи, слоны, панды, львы, тигры, певчие птицы, бегемоты, носороги, антилопы, и жирафы.
В коллекции зоопарка находится свыше 7 тыс животных, представлено более 600 различных видов.